Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms