Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDR1Q08345 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms