Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms