Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms