Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms