Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CD164Q04900 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms