Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ERCC6Q03468 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms