Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms