Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms