Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL7P80098 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL7P80098 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL7P80098 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL7P80098 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL7P80098 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL7P80098 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL7P80098 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL7P80098 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL7P80098 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL7P80098 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL7P80098 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL7P80098 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL7P80098 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL7P80098 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL7P80098 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL7P80098 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL7P80098 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL7P80098 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL7P80098 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL7P80098 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL7P80098 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL7P80098 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL7P80098 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL7P80098 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL7P80098 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL7P80098 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL7P80098 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL7P80098 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL7P80098 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL7P80098 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL7P80098 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL7P80098 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL7P80098 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL7P80098 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL7P80098 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL7P80098 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL7P80098 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL7P80098 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL7P80098 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL7P80098 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL7P80098 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL7P80098 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL7P80098 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL7P80098 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL7P80098 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL7P80098 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL7P80098 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL7P80098 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL7P80098 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL7P80098 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL7P80098 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL7P80098 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL7P80098 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL7P80098 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL7P80098 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL7P80098 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL7P80098 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL7P80098 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL7P80098 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL7P80098 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL7P80098 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL7P80098 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL7P80098 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL7P80098 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL7P80098 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL7P80098 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL7P80098 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL7P80098 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL7P80098 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL7P80098 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL7P80098 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL7P80098 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL7P80098 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL7P80098 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL7P80098 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL7P80098 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL7P80098 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL7P80098 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL7P80098 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL7P80098 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL7P80098 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL7P80098 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL7P80098 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL7P80098 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL7P80098 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL7P80098 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL7P80098 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL7P80098 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL7P80098 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCL7P80098 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCL7P80098 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CCL7P80098 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCL7P80098 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCL7P80098 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCL7P80098 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCL7P80098 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL7P80098 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL7P80098 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL7P80098 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms