Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTBP60709 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTBP60709 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTBP60709 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTBP60709 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTBP60709 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTBP60709 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTBP60709 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTBP60709 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTBP60709 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTBP60709 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTBP60709 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTBP60709 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTBP60709 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTBP60709 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTBP60709 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTBP60709 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTBP60709 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTBP60709 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTBP60709 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTBP60709 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTBP60709 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTBP60709 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTBP60709 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTBP60709 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTBP60709 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTBP60709 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTBP60709 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTBP60709 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTBP60709 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTBP60709 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTBP60709 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTBP60709 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTBP60709 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTBP60709 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTBP60709 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTBP60709 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTBP60709 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTBP60709 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTBP60709 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTBP60709 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTBP60709 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTBP60709 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTBP60709 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTBP60709 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTBP60709 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTBP60709 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTBP60709 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTBP60709 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTBP60709 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTBP60709 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTBP60709 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTBP60709 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTBP60709 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTBP60709 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTBP60709 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTBP60709 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTBP60709 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTBP60709 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTBP60709 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTBP60709 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTBP60709 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTBP60709 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTBP60709 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTBP60709 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTBP60709 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTBP60709 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTBP60709 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTBP60709 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTBP60709 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTBP60709 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTBP60709 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTBP60709 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTBP60709 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTBP60709 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTBP60709 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTBP60709 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTBP60709 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTBP60709 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTBP60709 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTBP60709 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTBP60709 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTBP60709 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTBP60709 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTBP60709 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTBP60709 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTBP60709 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTBP60709 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTBP60709 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTBP60709 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTBP60709 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTBP60709 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTBP60709 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTBP60709 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTBP60709 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTBP60709 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTBP60709 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTBP60709 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTBP60709 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTBP60709 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms