Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms