Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVFC1P60507 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVFC1P60507 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVFC1P60507 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVFC1P60507 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVFC1P60507 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVFC1P60507 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVFC1P60507 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVFC1P60507 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVFC1P60507 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVFC1P60507 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVFC1P60507 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVFC1P60507 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVFC1P60507 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVFC1P60507 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVFC1P60507 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVFC1P60507 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVFC1P60507 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVFC1P60507 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVFC1P60507 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVFC1P60507 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms