Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H2BFSP57053 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H2BFSP57053 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2BFSP57053 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
H2BFSP57053 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2BFSP57053 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H2BFSP57053 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H2BFSP57053 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2BFSP57053 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2BFSP57053 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2BFSP57053 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2BFSP57053 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2BFSP57053 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2BFSP57053 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2BFSP57053 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2BFSP57053 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
H2BFSP57053 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2BFSP57053 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
H2BFSP57053 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2BFSP57053 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2BFSP57053 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2BFSP57053 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2BFSP57053 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2BFSP57053 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2BFSP57053 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
H2BFSP57053 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2BFSP57053 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2BFSP57053 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2BFSP57053 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
H2BFSP57053 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2BFSP57053 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.03■□□□□ -0
H2BFSP57053 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2BFSP57053 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
H2BFSP57053 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2BFSP57053 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2BFSP57053 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2BFSP57053 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2BFSP57053 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2BFSP57053 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2BFSP57053 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2BFSP57053 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
H2BFSP57053 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
H2BFSP57053 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2BFSP57053 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2BFSP57053 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
H2BFSP57053 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2BFSP57053 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2BFSP57053 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
H2BFSP57053 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
H2BFSP57053 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2BFSP57053 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2BFSP57053 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
H2BFSP57053 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.02■□□□□ -0
H2BFSP57053 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
H2BFSP57053 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
H2BFSP57053 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
H2BFSP57053 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
H2BFSP57053 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2BFSP57053 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2BFSP57053 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2BFSP57053 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2BFSP57053 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
H2BFSP57053 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
H2BFSP57053 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.02■□□□□ -0
H2BFSP57053 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2BFSP57053 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
H2BFSP57053 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
H2BFSP57053 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
H2BFSP57053 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
H2BFSP57053 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
H2BFSP57053 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
H2BFSP57053 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
H2BFSP57053 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms