Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PLTPP55058 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PLTPP55058 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLTPP55058 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLTPP55058 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLTPP55058 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLTPP55058 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLTPP55058 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLTPP55058 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLTPP55058 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PLTPP55058 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLTPP55058 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLTPP55058 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLTPP55058 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLTPP55058 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PLTPP55058 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLTPP55058 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLTPP55058 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PLTPP55058 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLTPP55058 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLTPP55058 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLTPP55058 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLTPP55058 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLTPP55058 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLTPP55058 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLTPP55058 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLTPP55058 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLTPP55058 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLTPP55058 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLTPP55058 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLTPP55058 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLTPP55058 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLTPP55058 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLTPP55058 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLTPP55058 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLTPP55058 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLTPP55058 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLTPP55058 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PLTPP55058 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLTPP55058 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PLTPP55058 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLTPP55058 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLTPP55058 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLTPP55058 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLTPP55058 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLTPP55058 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLTPP55058 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLTPP55058 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLTPP55058 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PLTPP55058 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLTPP55058 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLTPP55058 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLTPP55058 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLTPP55058 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLTPP55058 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLTPP55058 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLTPP55058 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLTPP55058 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLTPP55058 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLTPP55058 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLTPP55058 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLTPP55058 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLTPP55058 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLTPP55058 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLTPP55058 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLTPP55058 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLTPP55058 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLTPP55058 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLTPP55058 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLTPP55058 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLTPP55058 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PLTPP55058 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PLTPP55058 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLTPP55058 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLTPP55058 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLTPP55058 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLTPP55058 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLTPP55058 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLTPP55058 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLTPP55058 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLTPP55058 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLTPP55058 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLTPP55058 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLTPP55058 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLTPP55058 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLTPP55058 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLTPP55058 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLTPP55058 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLTPP55058 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLTPP55058 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PLTPP55058 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLTPP55058 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLTPP55058 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLTPP55058 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PLTPP55058 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLTPP55058 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLTPP55058 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLTPP55058 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLTPP55058 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLTPP55058 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms