Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC12A2P55011 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC12A2P55011 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC12A2P55011 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC12A2P55011 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC12A2P55011 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC12A2P55011 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC12A2P55011 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms