Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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PGGT1BP53609 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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PGGT1BP53609 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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PGGT1BP53609 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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PGGT1BP53609 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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