Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms