Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNQ1P51787 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms