Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DAP3P51398 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DAP3P51398 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DAP3P51398 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DAP3P51398 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DAP3P51398 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DAP3P51398 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DAP3P51398 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DAP3P51398 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DAP3P51398 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DAP3P51398 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DAP3P51398 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DAP3P51398 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DAP3P51398 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DAP3P51398 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DAP3P51398 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DAP3P51398 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DAP3P51398 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DAP3P51398 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DAP3P51398 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DAP3P51398 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DAP3P51398 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DAP3P51398 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DAP3P51398 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DAP3P51398 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DAP3P51398 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DAP3P51398 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DAP3P51398 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DAP3P51398 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DAP3P51398 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DAP3P51398 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DAP3P51398 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DAP3P51398 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DAP3P51398 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DAP3P51398 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DAP3P51398 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DAP3P51398 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DAP3P51398 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DAP3P51398 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DAP3P51398 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DAP3P51398 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DAP3P51398 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DAP3P51398 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DAP3P51398 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DAP3P51398 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DAP3P51398 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DAP3P51398 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DAP3P51398 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DAP3P51398 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DAP3P51398 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DAP3P51398 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DAP3P51398 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DAP3P51398 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DAP3P51398 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DAP3P51398 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DAP3P51398 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DAP3P51398 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DAP3P51398 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DAP3P51398 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DAP3P51398 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DAP3P51398 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DAP3P51398 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DAP3P51398 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DAP3P51398 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DAP3P51398 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DAP3P51398 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DAP3P51398 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DAP3P51398 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DAP3P51398 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DAP3P51398 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DAP3P51398 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DAP3P51398 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DAP3P51398 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DAP3P51398 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DAP3P51398 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DAP3P51398 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DAP3P51398 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DAP3P51398 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DAP3P51398 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DAP3P51398 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DAP3P51398 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DAP3P51398 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DAP3P51398 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DAP3P51398 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DAP3P51398 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DAP3P51398 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DAP3P51398 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DAP3P51398 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DAP3P51398 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DAP3P51398 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DAP3P51398 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DAP3P51398 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DAP3P51398 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DAP3P51398 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DAP3P51398 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DAP3P51398 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DAP3P51398 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DAP3P51398 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DAP3P51398 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DAP3P51398 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms