Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTPAP49638 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTPAP49638 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTPAP49638 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTPAP49638 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTPAP49638 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTPAP49638 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TTPAP49638 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTPAP49638 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTPAP49638 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTPAP49638 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTPAP49638 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTPAP49638 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTPAP49638 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTPAP49638 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTPAP49638 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTPAP49638 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTPAP49638 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTPAP49638 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TTPAP49638 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTPAP49638 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTPAP49638 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTPAP49638 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTPAP49638 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTPAP49638 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTPAP49638 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTPAP49638 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTPAP49638 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTPAP49638 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTPAP49638 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTPAP49638 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTPAP49638 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTPAP49638 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TTPAP49638 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTPAP49638 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTPAP49638 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTPAP49638 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTPAP49638 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTPAP49638 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTPAP49638 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTPAP49638 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTPAP49638 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTPAP49638 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTPAP49638 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTPAP49638 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTPAP49638 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TTPAP49638 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTPAP49638 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTPAP49638 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TTPAP49638 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTPAP49638 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTPAP49638 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTPAP49638 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTPAP49638 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTPAP49638 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTPAP49638 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms