Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms