Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL1P40616 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL1P40616 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL1P40616 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL1P40616 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL1P40616 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL1P40616 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL1P40616 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL1P40616 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL1P40616 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL1P40616 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL1P40616 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL1P40616 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL1P40616 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL1P40616 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL1P40616 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL1P40616 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL1P40616 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL1P40616 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL1P40616 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL1P40616 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL1P40616 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL1P40616 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL1P40616 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL1P40616 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL1P40616 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL1P40616 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL1P40616 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL1P40616 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARL1P40616 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARL1P40616 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARL1P40616 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARL1P40616 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARL1P40616 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARL1P40616 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ARL1P40616 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARL1P40616 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARL1P40616 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ARL1P40616 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARL1P40616 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARL1P40616 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARL1P40616 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ARL1P40616 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ARL1P40616 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARL1P40616 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARL1P40616 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARL1P40616 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARL1P40616 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARL1P40616 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARL1P40616 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARL1P40616 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARL1P40616 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARL1P40616 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARL1P40616 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARL1P40616 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARL1P40616 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARL1P40616 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARL1P40616 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL1P40616 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL1P40616 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL1P40616 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL1P40616 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL1P40616 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL1P40616 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL1P40616 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL1P40616 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL1P40616 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL1P40616 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL1P40616 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL1P40616 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL1P40616 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL1P40616 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL1P40616 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL1P40616 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL1P40616 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL1P40616 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL1P40616 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL1P40616 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL1P40616 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL1P40616 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL1P40616 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL1P40616 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL1P40616 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL1P40616 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL1P40616 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL1P40616 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL1P40616 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL1P40616 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL1P40616 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL1P40616 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL1P40616 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL1P40616 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL1P40616 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL1P40616 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL1P40616 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ARL1P40616 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ARL1P40616 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ARL1P40616 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ARL1P40616 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ARL1P40616 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms