Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGAEP38570 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms