Protein–RNA interactions for Protein: P36980

CFHR2, Complement factor H-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR2P36980 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CFHR2P36980 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CFHR2P36980 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CFHR2P36980 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms