Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJC1P36383 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJC1P36383 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJC1P36383 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJC1P36383 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJC1P36383 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJC1P36383 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJC1P36383 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GJC1P36383 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJC1P36383 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJC1P36383 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJC1P36383 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GJC1P36383 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GJC1P36383 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJC1P36383 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJC1P36383 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJC1P36383 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GJC1P36383 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJC1P36383 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJC1P36383 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJC1P36383 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJC1P36383 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJC1P36383 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJC1P36383 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJC1P36383 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GJC1P36383 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJC1P36383 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJC1P36383 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJC1P36383 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJC1P36383 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJC1P36383 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJC1P36383 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJC1P36383 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJC1P36383 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJC1P36383 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJC1P36383 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJC1P36383 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJC1P36383 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GJC1P36383 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJC1P36383 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJC1P36383 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GJC1P36383 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJC1P36383 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GJC1P36383 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJC1P36383 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJC1P36383 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GJC1P36383 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJC1P36383 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJC1P36383 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJC1P36383 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJC1P36383 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJC1P36383 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJC1P36383 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJC1P36383 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJC1P36383 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJC1P36383 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GJC1P36383 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJC1P36383 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJC1P36383 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GJC1P36383 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJC1P36383 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJC1P36383 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJC1P36383 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJC1P36383 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJC1P36383 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJC1P36383 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJC1P36383 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJC1P36383 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GJC1P36383 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJC1P36383 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJC1P36383 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GJC1P36383 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GJC1P36383 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJC1P36383 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJC1P36383 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJC1P36383 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJC1P36383 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJC1P36383 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJC1P36383 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJC1P36383 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJC1P36383 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJC1P36383 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJC1P36383 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJC1P36383 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJC1P36383 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJC1P36383 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJC1P36383 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJC1P36383 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJC1P36383 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJC1P36383 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJC1P36383 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJC1P36383 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJC1P36383 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJC1P36383 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJC1P36383 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJC1P36383 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJC1P36383 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJC1P36383 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJC1P36383 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJC1P36383 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1050.3 ms