Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms