Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms