Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms