Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms