Protein–RNA interactions for Protein: P25942

CD40, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 5, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40P25942 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40P25942 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40P25942 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40P25942 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40P25942 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40P25942 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40P25942 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40P25942 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40P25942 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40P25942 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40P25942 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40P25942 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40P25942 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40P25942 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40P25942 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40P25942 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40P25942 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40P25942 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40P25942 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40P25942 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40P25942 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40P25942 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40P25942 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40P25942 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40P25942 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40P25942 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40P25942 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40P25942 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40P25942 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40P25942 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40P25942 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40P25942 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40P25942 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40P25942 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40P25942 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40P25942 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40P25942 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40P25942 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40P25942 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40P25942 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40P25942 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40P25942 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40P25942 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40P25942 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40P25942 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40P25942 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40P25942 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40P25942 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40P25942 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40P25942 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40P25942 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40P25942 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40P25942 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40P25942 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40P25942 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40P25942 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40P25942 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40P25942 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40P25942 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40P25942 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40P25942 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40P25942 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40P25942 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40P25942 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40P25942 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40P25942 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40P25942 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40P25942 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40P25942 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40P25942 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40P25942 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40P25942 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40P25942 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40P25942 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40P25942 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40P25942 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40P25942 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40P25942 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40P25942 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40P25942 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40P25942 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40P25942 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40P25942 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40P25942 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40P25942 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40P25942 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40P25942 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40P25942 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40P25942 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40P25942 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40P25942 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40P25942 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40P25942 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40P25942 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40P25942 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40P25942 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40P25942 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40P25942 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40P25942 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40P25942 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms