Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms