Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSSP25774 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSSP25774 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSSP25774 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSSP25774 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSSP25774 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSSP25774 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSSP25774 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSSP25774 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSSP25774 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSSP25774 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSSP25774 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSSP25774 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSSP25774 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSSP25774 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSSP25774 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSSP25774 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSSP25774 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSSP25774 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSSP25774 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSSP25774 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSSP25774 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSSP25774 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSSP25774 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSSP25774 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSSP25774 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSSP25774 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSSP25774 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSSP25774 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSSP25774 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSSP25774 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSSP25774 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSSP25774 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSSP25774 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSSP25774 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSSP25774 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSSP25774 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTSSP25774 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTSSP25774 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTSSP25774 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTSSP25774 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSSP25774 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSSP25774 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSSP25774 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSSP25774 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSSP25774 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSSP25774 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSSP25774 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSSP25774 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSSP25774 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSSP25774 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSSP25774 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSSP25774 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSSP25774 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSSP25774 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSSP25774 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSSP25774 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSSP25774 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSSP25774 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSSP25774 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms