Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms