Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT1P21579 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT1P21579 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT1P21579 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT1P21579 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT1P21579 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT1P21579 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT1P21579 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT1P21579 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT1P21579 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT1P21579 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT1P21579 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT1P21579 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT1P21579 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT1P21579 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT1P21579 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT1P21579 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT1P21579 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT1P21579 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT1P21579 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT1P21579 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT1P21579 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT1P21579 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT1P21579 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT1P21579 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT1P21579 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT1P21579 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT1P21579 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYT1P21579 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYT1P21579 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SYT1P21579 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYT1P21579 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYT1P21579 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYT1P21579 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SYT1P21579 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYT1P21579 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYT1P21579 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYT1P21579 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYT1P21579 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYT1P21579 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYT1P21579 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SYT1P21579 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYT1P21579 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYT1P21579 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYT1P21579 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYT1P21579 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYT1P21579 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYT1P21579 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYT1P21579 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYT1P21579 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYT1P21579 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYT1P21579 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYT1P21579 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYT1P21579 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYT1P21579 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT1P21579 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT1P21579 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT1P21579 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT1P21579 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT1P21579 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT1P21579 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT1P21579 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT1P21579 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT1P21579 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT1P21579 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT1P21579 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT1P21579 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT1P21579 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT1P21579 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT1P21579 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT1P21579 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT1P21579 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT1P21579 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT1P21579 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT1P21579 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT1P21579 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT1P21579 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT1P21579 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT1P21579 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT1P21579 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT1P21579 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT1P21579 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT1P21579 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT1P21579 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT1P21579 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT1P21579 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT1P21579 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT1P21579 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT1P21579 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT1P21579 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT1P21579 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT1P21579 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT1P21579 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT1P21579 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT1P21579 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT1P21579 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT1P21579 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT1P21579 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT1P21579 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT1P21579 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms