Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms