Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRHP20396 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRHP20396 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRHP20396 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRHP20396 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRHP20396 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRHP20396 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRHP20396 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRHP20396 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRHP20396 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRHP20396 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRHP20396 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRHP20396 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRHP20396 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRHP20396 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRHP20396 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRHP20396 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRHP20396 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRHP20396 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRHP20396 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRHP20396 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRHP20396 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRHP20396 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRHP20396 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TRHP20396 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRHP20396 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRHP20396 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRHP20396 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRHP20396 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRHP20396 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRHP20396 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRHP20396 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRHP20396 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TRHP20396 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TRHP20396 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TRHP20396 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TRHP20396 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRHP20396 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRHP20396 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRHP20396 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TRHP20396 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRHP20396 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TRHP20396 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRHP20396 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TRHP20396 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRHP20396 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TRHP20396 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TRHP20396 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TRHP20396 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRHP20396 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRHP20396 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRHP20396 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRHP20396 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRHP20396 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRHP20396 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRHP20396 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRHP20396 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRHP20396 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRHP20396 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRHP20396 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRHP20396 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRHP20396 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRHP20396 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRHP20396 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRHP20396 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRHP20396 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRHP20396 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRHP20396 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRHP20396 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRHP20396 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRHP20396 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TRHP20396 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TRHP20396 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRHP20396 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRHP20396 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRHP20396 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRHP20396 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRHP20396 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRHP20396 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TRHP20396 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRHP20396 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRHP20396 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TRHP20396 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRHP20396 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRHP20396 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRHP20396 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TRHP20396 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TRHP20396 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TRHP20396 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRHP20396 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TRHP20396 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRHP20396 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRHP20396 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRHP20396 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRHP20396 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRHP20396 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRHP20396 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRHP20396 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRHP20396 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRHP20396 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms