Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CD53P19397 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD53P19397 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD53P19397 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD53P19397 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD53P19397 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD53P19397 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD53P19397 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD53P19397 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD53P19397 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD53P19397 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD53P19397 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD53P19397 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD53P19397 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD53P19397 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD53P19397 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD53P19397 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD53P19397 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD53P19397 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CD53P19397 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD53P19397 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CD53P19397 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD53P19397 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD53P19397 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD53P19397 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD53P19397 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD53P19397 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD53P19397 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD53P19397 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD53P19397 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD53P19397 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD53P19397 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD53P19397 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD53P19397 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD53P19397 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD53P19397 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD53P19397 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD53P19397 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD53P19397 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD53P19397 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD53P19397 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD53P19397 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD53P19397 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD53P19397 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD53P19397 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD53P19397 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD53P19397 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD53P19397 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD53P19397 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD53P19397 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD53P19397 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD53P19397 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD53P19397 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CD53P19397 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD53P19397 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD53P19397 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD53P19397 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD53P19397 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms