Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCC1P18754 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCC1P18754 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RCC1P18754 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCC1P18754 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCC1P18754 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCC1P18754 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCC1P18754 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCC1P18754 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCC1P18754 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RCC1P18754 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCC1P18754 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCC1P18754 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCC1P18754 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCC1P18754 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCC1P18754 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCC1P18754 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCC1P18754 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCC1P18754 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCC1P18754 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCC1P18754 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCC1P18754 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC1P18754 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms