Protein–RNA interactions for Protein: P17029

ZKSCAN1, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN1P17029 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms