Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms