Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms