Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms