Protein–RNA interactions for Protein: P0DP58

LYNX1, Ly-6/neurotoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNX1P0DP58 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYNX1P0DP58 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms