Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms