Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP10P09238 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP10P09238 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP10P09238 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP10P09238 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP10P09238 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP10P09238 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP10P09238 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP10P09238 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP10P09238 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP10P09238 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP10P09238 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP10P09238 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MMP10P09238 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP10P09238 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP10P09238 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP10P09238 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP10P09238 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP10P09238 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP10P09238 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP10P09238 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP10P09238 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP10P09238 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP10P09238 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP10P09238 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP10P09238 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP10P09238 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP10P09238 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP10P09238 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP10P09238 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP10P09238 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP10P09238 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP10P09238 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP10P09238 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP10P09238 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP10P09238 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP10P09238 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP10P09238 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP10P09238 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP10P09238 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP10P09238 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP10P09238 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP10P09238 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP10P09238 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP10P09238 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP10P09238 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP10P09238 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP10P09238 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP10P09238 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP10P09238 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP10P09238 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP10P09238 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP10P09238 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP10P09238 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP10P09238 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP10P09238 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP10P09238 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP10P09238 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP10P09238 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP10P09238 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP10P09238 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP10P09238 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP10P09238 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP10P09238 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP10P09238 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP10P09238 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP10P09238 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP10P09238 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP10P09238 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP10P09238 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP10P09238 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP10P09238 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP10P09238 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP10P09238 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP10P09238 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP10P09238 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP10P09238 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP10P09238 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP10P09238 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP10P09238 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP10P09238 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP10P09238 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP10P09238 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP10P09238 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP10P09238 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP10P09238 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP10P09238 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP10P09238 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP10P09238 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP10P09238 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP10P09238 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP10P09238 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP10P09238 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP10P09238 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP10P09238 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP10P09238 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP10P09238 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP10P09238 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP10P09238 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP10P09238 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms