Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK1P06493 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK1P06493 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK1P06493 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK1P06493 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK1P06493 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK1P06493 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK1P06493 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK1P06493 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK1P06493 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK1P06493 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK1P06493 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK1P06493 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK1P06493 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK1P06493 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK1P06493 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK1P06493 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK1P06493 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK1P06493 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK1P06493 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK1P06493 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK1P06493 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK1P06493 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK1P06493 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK1P06493 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK1P06493 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK1P06493 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK1P06493 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK1P06493 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK1P06493 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK1P06493 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK1P06493 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK1P06493 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK1P06493 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK1P06493 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK1P06493 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK1P06493 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK1P06493 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK1P06493 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK1P06493 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK1P06493 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK1P06493 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK1P06493 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK1P06493 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK1P06493 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK1P06493 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK1P06493 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK1P06493 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK1P06493 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK1P06493 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK1P06493 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK1P06493 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK1P06493 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK1P06493 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK1P06493 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK1P06493 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK1P06493 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK1P06493 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK1P06493 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK1P06493 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK1P06493 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK1P06493 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK1P06493 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK1P06493 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK1P06493 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK1P06493 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK1P06493 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK1P06493 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK1P06493 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK1P06493 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK1P06493 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK1P06493 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK1P06493 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK1P06493 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK1P06493 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK1P06493 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK1P06493 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK1P06493 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK1P06493 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK1P06493 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK1P06493 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK1P06493 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK1P06493 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK1P06493 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK1P06493 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK1P06493 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK1P06493 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK1P06493 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK1P06493 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK1P06493 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK1P06493 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK1P06493 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK1P06493 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK1P06493 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK1P06493 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK1P06493 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK1P06493 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK1P06493 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK1P06493 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK1P06493 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms