Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
F13BP05160 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
F13BP05160 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
F13BP05160 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
F13BP05160 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
F13BP05160 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
F13BP05160 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
F13BP05160 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
F13BP05160 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
F13BP05160 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
F13BP05160 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
F13BP05160 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
F13BP05160 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
F13BP05160 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13BP05160 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13BP05160 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13BP05160 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13BP05160 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13BP05160 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13BP05160 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms