Protein–RNA interactions for Protein: P01857

IGHG1, Immunoglobulin heavy constant gamma 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG1P01857 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHG1P01857 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms