Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG7O95352 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG7O95352 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG7O95352 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG7O95352 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG7O95352 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG7O95352 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG7O95352 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG7O95352 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG7O95352 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG7O95352 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG7O95352 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG7O95352 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG7O95352 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG7O95352 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG7O95352 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG7O95352 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG7O95352 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG7O95352 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG7O95352 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG7O95352 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG7O95352 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG7O95352 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG7O95352 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG7O95352 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG7O95352 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG7O95352 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG7O95352 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG7O95352 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG7O95352 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG7O95352 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG7O95352 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG7O95352 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG7O95352 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG7O95352 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG7O95352 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG7O95352 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG7O95352 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG7O95352 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG7O95352 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG7O95352 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG7O95352 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG7O95352 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG7O95352 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG7O95352 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG7O95352 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG7O95352 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG7O95352 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG7O95352 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG7O95352 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG7O95352 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG7O95352 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG7O95352 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG7O95352 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG7O95352 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG7O95352 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG7O95352 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG7O95352 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG7O95352 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG7O95352 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG7O95352 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG7O95352 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG7O95352 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG7O95352 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG7O95352 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG7O95352 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG7O95352 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG7O95352 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG7O95352 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG7O95352 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG7O95352 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG7O95352 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG7O95352 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG7O95352 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG7O95352 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG7O95352 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG7O95352 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG7O95352 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG7O95352 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG7O95352 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG7O95352 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG7O95352 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG7O95352 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG7O95352 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG7O95352 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG7O95352 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG7O95352 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG7O95352 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG7O95352 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG7O95352 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG7O95352 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG7O95352 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG7O95352 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG7O95352 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG7O95352 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG7O95352 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG7O95352 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG7O95352 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG7O95352 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG7O95352 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms